文件

  • 使用者指南

    閱讀此開發人員指南中的逐步指示,了解如何使用 AWS HealthOmics。

  • API 參考

    閱讀此參考指南,了解 AWS HealthOmics API 和參數。

教學

工具

工作流程工具

藥物探索工作流程

使用此 AWS HealthOmics 工作流程集合來加速藥物探索

工作流程範例

根據開放原始碼 HealthOmics 工作流程範例來建置私有工作流程

Run Analyzer

Run analyzer 是一種執行效能最佳化工具,可從 CloudWatch 擷取執行資訊清單日誌,並為執行產生統計資料,包括每個工作流程任務的 CPU 和記憶體使用率

WDL Linter

在執行工作流程之前,使用 HealthOmics WDL Linter 來偵測常見的工作流程錯誤

Nextflow Linter

執行工作流程指令碼之前偵測常見的 Nextflow 錯誤

ECR 輔助工具

使用 ECR 輔助工具將現有容器遷移至您的私有 ECR 儲存器

重新執行工具

從 CloudWatch 執行資訊清單日誌重新執行封存的執行項

資料儲存工具

讀取集傳輸管理器

從 AWS HealthOmics 參考或讀取集輕鬆下載檔案

事件驅動匯入工具

CDK 應用程式示範了一個事件驅動型架構,在 Amazon S3 中建立物件時,可將資料自動匯入 AWS HealthOmics 序列存放區。

序列儲存資訊清單產生器

為 AWS HealthOmics 序列儲存匯入任務產生 json 資訊清單

序列存放重複讀取集搜尋工具

識別存放在 AWS HelathOmics 序列存放區中的重複讀取集

解決方案

影片


克服與擴展體學分析關聯的科學與 IT 挑戰 (22:11)


革新精密醫學:Sonrai 使用 AWS 探索藥物 (3:03)


AWS re:Invent 2023 – 使用 AWS HealthOmics 進行體學創新:Amgen 加速取得成果的途徑


AWS re:Invent 2023 – 使用 AWS HealthOmics 建置精密醫學平台


AWS HealthOmics 端對端研討會 – 簡報 (43:27)


AWS On Air ft.AWS HealthOmics 與開放資料 (20:07)


使用 AWS HealthOmics 實現基因體學端對端 (2:03:06)


AWS On Air ft.AWS HealthOmics 上的 Ready2Run 工作流程 (26:34)