Tamarind Bio Mendorong Penemuan Obat Berbantuan AI dengan AWS

Tim penelitian dan pengembangan (R&D) serta ilmuwan hayati mendedikasikan karier mereka untuk menemukan pengobatan bagi beberapa penyakit paling rumit yang dihadapi umat manusia. Mengingat kompleksitas biologi manusia, pengembangan obat terobosan ini merupakan upaya yang mahal dan memakan waktu bertahun-tahun. AI kini memegang kunci untuk mempercepat penelitian medis yang menyelamatkan jiwa dalam skala besar—tetapi hanya jika dapat diakses oleh para ahli yang mendorong proyek-proyek tersebut maju.

Sering kali, ilmuwan hayati masih belum mampu memanfaatkan model AI untuk mendorong penelitian terkemuka dalam waktu singkat. Jika mereka mampu, mereka harus bergantung pada kolega yang memiliki keahlian teknologi untuk melakukan deployment dan menjalankan model bahasa besar (LLM) atas nama mereka. Hal ini tidak hanya memperlambat momentum, tetapi mereka juga seringkali kesulitan untuk mengikuti perkembangan model-model terbaru. CEO dan Co-founder Tamarind Bio, Deniz Kavi, menjelaskan masalah yang beliau saksikan langsung sebagai ilmuwan data: “Di lab sarjana saya di Stanford, saya sepenuhnya dipekerjakan untuk menjadi manusia yang menjalankan model-model ini. Kami memiliki begitu banyak permintaan dari publikasi serta kolaborator sehingga menjalankannya secara manual menjadi tidak mungkin.”

Menyadari bahwa perusahaan bioteknologi dan farmasi menghadapi hambatan yang sama, Deniz Kavi dan Sherry Liu ikut mendirikan Tamarind Bio pada tahun 2023. Dengan visi untuk memberikan kemampuan AI di tangan setiap ilmuwan, mereka mengembangkan platform di AWS untuk membantu mengubah ide menjadi obat nyata secepat mungkin. Startup ini kini melayani perusahaan farmasi terkemuka di dunia setiap hari serta membantu ribuan ilmuwan menemukan molekul baru. Seperti yang dikatakan Sherry Liu, CTO dan Co-founder,: “Para ilmuwan telah menghemat ribuan jam yang seharusnya mereka habiskan untuk menyiapkan model, menjalankan skrip lokal, dan mengolah data, dengan imbalan platform yang lancar dengan semua alat terbaik di satu tempat.”

Obat untuk biologi komputasional yang kompleks

Antarmuka sederhana Tamarind membuat AI dapat diakses oleh semua ilmuwan dengan mengurus semua kebutuhan infrastruktur dan menghubungkannya dengan model terbaru saat mereka muncul. Tim R&D dibekali untuk memecahkan tantangan medis terbesar masyarakat dengan penggunaan model canggih skala besar seperti AlphaFold dan RFdiffusion. Alat seperti ini memungkinkan tim untuk lebih memahami apa yang dilakukan protein serta bagaimana mereka berinteraksi dengan molekul lain dalam jangka waktu yang jauh lebih singkat—komponen yang sangat rumit tetapi penting dalam membuat penemuan inovatif. Seperti yang dijelaskan Liu, “Kami memungkinkan para ilmuwan untuk menggunakan model ini dalam jalur, yang jika tidak akan memerlukan konfigurasi kustom untuk menyiapkan dan terus memperbaruinya.” Karena para ilmuwan tidak perlu khawatir tentang kode, Tamarind membantu mereka memfokuskan waktu dan sumber daya mereka di tempat yang penting.

Sebagai startup, Tamarind ditugaskan untuk mendapatkan kepercayaan dari perusahaan mapan sebelum mereka dapat menunjukkan dampak dunia nyata. Bekerja sama dengan AWS sejak awal untuk membangun platformnya, perusahaan ini mampu memulai pertumbuhan pesat mereka. Seperti yang dikatakan Kavi, “Jika kami tidak menggunakan penyedia cloud yang paling tepercaya, saya rasa mustahil untuk bekerja sama dengan perusahaan farmasi besar.”

Kemitraan ini telah membantu Tamarind membangun kredibilitas dengan cepat, sekaligus menawarkan panduan implementasi praktik langsung. Perusahaan ini kini menggunakan puluhan layanan AWS untuk meng-host beberapa ratus model dan tetap tangkas menghadapi perubahan permintaan, termasuk Amazon Bedrock, Amazon EC2, Amazon S3, Amazon DynamoDB, serta Amazon EKS. “Kami mengelola banyak infrastruktur dan itu dilakukan dengan sangat lancar melalui AWS. Mustahil bagi kami untuk membangunnya di pusat data atau menggunakan penyedia cloud lain dalam konteks ini,” kata Kavi.

Mempercepat eksperimen dengan AI agentik

Dalam misinya untuk membuat alat rekayasa protein yang sederhana dan dapat diakses, Tamarind mengintegrasikan asisten AI agentik untuk “menjalankan tugas dan menganalisis hasil,” kata Liu. Kavi menjelaskan bahwa “Para ilmuwan memiliki intuisi serta ide untuk memecahkan masalah, tetapi mereka sering tidak memiliki keahlian untuk membuat sistem untuk menyimulasikan eksperimen. Kami percaya AI agentik akan memungkinkan mereka untuk berpikir lebih banyak tentang gambaran besar.”

Startup ini menghilangkan kompleksitas ilmu komputasional dengan menghubungkan semua alur kerja dan peralatan AWS miliknya ke LLM di Amazon Bedrock. Sebelumnya, para ilmuwan harus menulis kode untuk setiap tugas dalam proses penemuan obat, menambahkan segala sesuatu mulai dari ion hingga air dan membran satu per satu. Tamarind Copilot, alat AI agentiknya, menangani persiapan ekstensif ini serta memungkinkan pengguna untuk menyimulasikan sistem molekuler yang kompleks dalam bahasa Inggris sederhana dan mengulangi eksperimen dengan cara yang sebelumnya tidak mungkin dilakukan.

Menggambarkan proses pengembangan alat ini, Kavi mengatakan: “Tim AWS memandu kami melalui cara terbaik untuk mengimplementasikan dan membuatnya dapat diskalakan. Hal ini merupakan proses yang lancar untuk mengimplementasikannya dari sana.” Sejak diluncurkan, Tamarind dapat terus mengembangkan penawaran AI agentiknya dengan cara yang terstruktur dan aman seiring kemajuan teknologi menggunakan Amazon Bedrock. “Memiliki model baru yang tersedia di AWS dari waktu ke waktu merupakan bantuan besar bagi kami. Hal ini adalah skema standar yang sama serta kebutuhan IT tepercaya yang sama,” tambah Kavi.

Menskalakan kemampuan ilmuwan

Mengingat kompleksitas dalam menjalankan model uji, sejumlah besar komputasi diperlukan untuk mengatasi lonjakan permintaan. Dengan AWS, Tamarind dapat memanfaatkan skalabilitas performa tinggi tanpa melakukan investasi awal yang besar. “Dengan fitur penskalaan otomatis dari AWS, kami dapat beralih dari nol menjadi 10.000 GPU dalam hitungan beberapa menit,” kata Kavi. Startup ini dapat dengan cepat membuktikan kemampuan produknya kepada perusahaan farmasi besar sambil hanya menggunakan sumber daya yang dibutuhkannya, karena membutuhkannya.

Untuk membuat dan mengakhiri ratusan model sesuai permintaan dengan aman, Tamarind menggunakan Amazon EC2 dan Amazon EKS. “Menggunakan instans spot telah memungkinkan kami menghemat lebih dari 50 persen pada komputasi, sambil mempertahankan ketersediaan yang dapat diskalakan. Menangani beban kerja kami yang melonjak tidak akan mungkin dilakukan tanpa AWS,” kata Liu. Perusahaan ini juga menggunakan Amazon S3 untuk penyimpanan objek yang dapat diskalakan dan Amazon DynamoDB untuk basis data yang terkelola penuh dengan performa tinggi pada skala apa pun.

Sejak awal, para manajer akun AWS yang berdedikasi juga telah mendukung bisnis melalui panduan berkelanjutan, lokakarya, dan Kredit AWS Activate untuk menjelajahi berbagai layanan. “AWS benar-benar peduli dengan kebutuhan kami dan mampu memberikan dukungan teknis serta waktu respons yang cepat,” kata Liu. Baik itu mengoptimalkan biaya maupun berkolaborasi dalam pengembangan produk, Kavi menambahkan: “Satu hal yang menakjubkan adalah kami dapat merasakan bahwa AWS adalah partner jangka panjang. AWS sangat fokus untuk memastikan kami sukses dan kami merasa sangat sejalan.” Mulai dari mengutamakan tujuan Tamarind hingga bertindak sebagai “perpanjangan tim”, pertumbuhan eksplosif Tamarind sejak awal telah didukung oleh keahlian komprehensif dan saran arsitektur cloud kustom.

Mengamankan pelanggan terkemuka di dunia  

Di dunia biotek dan farmasi, data sangatlah sensitif, mencakup molekul yang belum dipatenkan yang pada akhirnya menjadi obat miliaran dolar. Oleh karena itu, setiap peristiwa kebocoran atau kehilangan data dapat berdampak buruk pada organisasi. Akibatnya, mereka menempatkan kepentingan tertinggi pada menjunjung tinggi standar keamanan yang ketat dan persyaratan kekayaan intelektual. Sebagai vendor yang ingin memproses data ini, salah satu tantangan awal Tamarind adalah menunjukkan kredensial keamanan mereka kepada perusahaan farmasi yang mapan.

Setelah mengetahui bahwa calon pelanggan sudah menggunakan AWS, perusahaan menemukan bahwa mereka dapat dengan cepat membangun kepercayaan melalui kemitraan dan menyederhanakan pengadaan. “AWS adalah penyedia tepercaya untuk organisasi R&D. Kebanyakan orang meminta kami untuk menggunakan AWS dari perspektif keamanan dan skalabilitas,” kata Kavi. AWS Key Management Service serta AWS Identity and Access Management juga “memungkinkan kami menciptakan infrastruktur multipenghuni yang aman,” kata Liu.

Seiring dengan pertumbuhannya yang pesat, Tamarind berupaya memperluas basis pelanggannya hingga mencakup laboratorium penelitian yang lebih kecil dan perusahaan biotek. Strateginya meliputi peningkatan inisiatif pemasaran bersama dengan AWS, seperti membangun eksposur di acara dan konferensi industri utama. Dengan melakukan hal tersebut, Tamarind berharap menjadi “toko satu atap” untuk R&D serta “platform tempat penemuan obat komputasional dilakukan,” kata Liu.

Menyembuhkan penyakit yang “belum dapat diobati”

Dengan tujuan utama untuk membuat R&D lebih efisien dan efektif, Tamarind mengambil pendekatan bercabang dua. Sambil terus mencari cara baru menggunakan AI untuk mengoptimalkan program penemuan obat yang ada, perusahaan ini juga berupaya menargetkan penyakit yang belum dievaluasi atau dipertimbangkan sebelumnya. “Karena AI berperilaku sangat berbeda dari dunia fisik, kami dapat mencoba menemukan obat untuk penyakit yang belum dapat diobati dan membuka bagian baru dari kontinum penyakit ini,” jelas Kavi.

Mempersiapkan peta jalan produk yang panjang, startup ini memandang AWS sebagai bagian integral dari perjalanan jangka panjangnya. Taktik inti untuk mengatasi penyakit yang tidak dapat diobati merupakan pengembangan AI agentik yang berkelanjutan yang makin mengurangi kompleksitas. Jika seorang ilmuwan memiliki ide untuk apa yang disebut Kavi sebagai “target menarik” ini, perusahaan bertujuan untuk membantu mereka segera mulai mengerjakannya dan beralih ke pengujian yang jauh lebih cepat—yang pada gilirannya berpotensi meningkatkan kehidupan jutaan orang.

Apakah Anda punya ide besar yang ingin Anda bangun dan luncurkan? Atau mungkin Anda adalah startup yang ingin menskalakan? Pelajari bagaimana Program AWS Activate dapat memulai kesuksesan dengan kredit gratis, dukungan teknis, pelatihan, sumber daya, dan lainnya. Jika Anda baru mengenal AWS, cari tahu cara memulainya serta jelajahi banyaknya dukungan yang tersedia di sepanjang perjalanan Anda.