Ressources AWS HealthOmics
Documentation
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Guide de l’utilisateur
Découvrez comment utiliser AWS HealthOmics dans ce guide du développeur pas à pas.
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Référence d'API
Lisez ce guide de référence sur les paramètres et API d’AWS HealthOmics.
Didacticiels
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Atelier complet sur HealthOmics
Démarrez avec les flux de travail et le stockage HealthOmics
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Tutoriels HealthOmics
Référentiel open source sur GitHub avec exemple de code qui montre comment stocker, traiter et interroger les jeux de données génomiques et biologiques à l’aide d’AWS HealthOmics
Outils
Outils de flux de travail
Workflows de découverte de médicaments
Utilisez cette collection de flux de travail AWS HealthOmics pour accélérer la découverte de médicaments
Exemples de flux de travail
Créez des flux de travail privés basés sur des exemples de flux de travail HealthOmics open source
Exécuter l'analyseur
Run analyzer est un outil d’optimisation des performances d'exécution qui extrait les journaux des manifestes d'exécution depuis CloudWatch et génère des statistiques pour une exécution, y compris l'utilisation du processeur et de la mémoire pour chaque tâche de flux de travail
WDL Linter
Utilisez le linter HealthOmics WDL pour détecter les erreurs de flux de travail courantes avant d’exécuter les flux de travail
Filtre Nextflow
Lint pour les erreurs Nextflow courantes avant l'exécution d'un script de flux de travail
ECR Helper
Migrez les conteneurs existants vers votre référentiel ECR privé à l’aide de l’outil d'assistance ECR
Outil de réexécution
Réexécutez les exécutions archivées à partir des journaux du manifeste d’exécution de CloudWatch
Outils de stockage de données
Lire régler le gestionnaire de transfert
Téléchargez facilement des fichiers à partir d'un ensemble de référence ou de lecture AWS HealthOmics
Importateur axé sur les événements
Application CDK présentant une architecture pilotée par les événements qui automatise l'importation de données dans les magasins de séquences AWS HealthOmics lorsque des objets sont créés dans Amazon S3.
Sequence Store Manifest Generator
Génère un manifeste json pour les tâches d'importation du magasin de séquences AWS HealthOmics
Sequence Store Duplicate Read Set Finder
Identifie les ensembles de lecture dupliqués stockés dans les magasins de séquences AWS HealthOmics
Solutions
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Conseils pour un maillage de données de laboratoire sur AWS
Ce guide explique comment créer un système de gestion des données scientifiques qui intègre à la fois les données des instruments de laboratoire et les systèmes logiciels, tels que les cahiers de laboratoire électroniques (ELN) et les systèmes de gestion des informations de laboratoire (LIMS), avec HealthOmics.
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Guide pour un laboratoire connecté numérique sur AWS
Ce guide vous aide à connecter les instruments de données relatives aux sciences de la vie et les fichiers des systèmes de laboratoire au Cloud AWS, soit par Internet, soit par une connexion directe à faible latence.
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Guide pour la migration et le stockage des données de séquences au moyen d’AWS HealthOmics
Ce guide décrit comment importer des données de séquences omiques d’Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) vers le stockage AWS HealthOmics.
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Guide pour l’analyse de données multimodales à l’aide des services d’AWS Health et ML
Ce guide explique la mise en place d’un cadre de bout en bout pour analyser les données multimodales relatives aux soins de santé et aux sciences de la vie (HCLS).
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Conseils pour les flux de travail bioinformatiques sur AWS
Ce guide explique comment créer et exécuter des flux de travail bioinformatiques de production à grande échelle et utiliser les services AWS pour l'automatisation, l'analyse des flux de travail, le stockage et l’observabilité opérationnelle et des coûts.
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Guide pour l’analyse de données multimodales à l’aide des services d’AWS Health et ML
Ce guide explique la mise en place d’un cadre de bout en bout pour analyser les données multimodales relatives aux soins de santé et aux sciences de la vie (HCLS).
Nouveautés
AWS HealthOmics prend désormais en charge la détection des versions DSL et Nextflow
13/08/24
AWS HealthOmics prend désormais en charge le stockage dynamique pour les flux de travail privés
30/04/24
AWS HealthOmics prend désormais en charge le partage intercomptes pour les flux de travail privés
30/04/24
AWS HealthOmics prend désormais en charge le flux de travail DeepVariant Ready2Run d'Ultima Genomics
05/02/24
AWS HealthOmics est désormais disponible dans la région Israël (Tel Aviv)
26/09/23
AWS HealthOmics prend désormais en charge la gestion des versions des magasins d’annotations
15/08/23
AWS HealthOmics prend en charge le partage entre comptes de magasins d’analytique Omics
15/08/23
Billets de blog
Révolutionnez la biologie générative avec AWS et EvolutionaryScale
25/06/2024
Comment Takeda Pharmaceuticals accélère la bioinformatique à grande échelle grâce à AWS HealthOmics
19/06/2024
Accédez à de puissantes informations génomiques avec AWS HealthOmics Analytics et Amazon EMR
30/05/2024
Orchestrer plusieurs flux de travail AWS HealthOmics à grande échelle
07/05/24
Démocratisez l’analyse des données omiques avec Basepair sur AWS HealthOmics
29/04/2024
Stockez les données omiques de manière rentable à n’importe quelle échelle avec AWS HealthOmics
24/01/24
Prétraitement des données IRMf sur AWS à l’aide d’AFNI et d’AWS HealthOmics
08/01/24
Nouveaux outils pour accélérer la migration des flux de travail vers AWS HealthOmics
13/12/23
Analyse multimodale des données avec AWS Health et les services de machine learning
16/10/23
Sécurisez vos flux de travail et vos données génomiques avec AWS HealthOmics
09/10/23
Vidéos
Surmonter les défis scientifiques et informatiques associés à la mise à l’échelle de l’analyse omique (22:11)
Révolutionner la médecine de précision : Sonrai utilise AWS pour la découverte de médicaments (3:03)
AWS re:Invent 2023 – Innovation en matière d’omics avec AWS HealthOmics : la voie d’Amgen vers des résultats plus rapides
AWS re:Invent 2023 – Création d’une plateforme de médecine de précision à l’aide d’AWS HealthOmics
Atelier AWS HealthOmics de bout en bout : présentation (43:27)
AWS On Air ft. AWS HealthOmics et données ouvertes (20:07)
Utilisation d’AWS HealthOmics pour la génomique de bout en bout (2:03:06)
AWS On Air ft. Flux de travail AWS HealthOmics Ready2Run (26:34)