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使用Amazon Step Functions Data Science SDK构建从AWS Glue Crawler到Glue Job的工作流程

对于数据科学家来讲,每天花费的大量时间主要在解决实际业务问题上,需要分析和收集支持信息,得出问题的结论。很多情况下,特定的任务和目标可能都需要一个人来完成,

而开发ETL又是必不可少的工作,什么样的平台可以满足他们的需求?

轻量化,免运维,交互式展现,自动化的工作流,可视化的监控,这些只需要在Jupyter Notebook中操作,就可以轻松地准备和加载数据以供分析。

在本文中,我们将利用无服务器架构工作流,用于表结构的爬取和执行ETL作业,从而实现上述步骤的自动化和可视化。

用产品的方式来解决,他们习惯用python代码在Jupyter Notebook中开发,图形化展示各种数据。创建可视化的端到端的工作流程,以最终输出结果为导向。跟业务无关的工作,其实是可以用产品的方式解决的

那么减少人工重复工作,监控每个任务的运行状态和日志记录,实现整个流程的自动化。

 

方案概述

本文将以一个常见的使用场景,通过

Amazon Step Functions Data Science SDK创建基于无服务器架构的工作流,过程如下:

  1. 创建Lambda调用Amazon Glue进行Crawler工作,识别数据格式和Schema
  2. 创建Lambda检查Amazon Glue Crawler工作状态,如果返回值为null,即认为Crawler执行完成
  3. 使用Amazon Glue进行ETL工作,生成样本数据集

下图演示了上述Amazon Step Functions无服务器架构工作流:

后续操作使用了下列亚马逊云科技服务:

Amazon Step Functions ,是由多个离散步骤组成的状态机,其中每个步骤都可以执行任务、作出选择、启动并行执行或管理超时。其中一个步骤的输出作为下一个步骤的输入,并支持将错误处理嵌入到工作流中。

Step Functions Data Science SDK,相比较Amazon Step Functions ,使用Python代码轻松创建、执行和可视化Step Function工作流,而不是只能使用基于JSON语言定义Step Function。

本文以Step Functions Data Science SDK为主线,讨论如何创建Step Function步骤、使用参数、集成服务特定的功能,将这些步骤关联在一起,创建和可视化工作流。

Amazon Glue是一项完全托管的提取、转换和加载(ETL)服务,在分布式Apache Spark环境中运行,能够充分利用Spark而无需管理基础设施。

1. 创建Glue Crawler和Glue Job

在控制面板中创建Glue Crawler,请参考手册

https://docs.thinkwithwp.com/zh_cn/glue/latest/dg/console-crawlers.html

在控制面板中创建Glue Job,请参考手册

https://docs.thinkwithwp.com/zh_cn/glue/latest/dg/add-job.html

2. 创建两个Lambda Functions

2.1 首先,创建一个启动Crawler作业的Lambda Functions,命名为Crawler_initial,本环境使用Python 3.8 Runtime

2.2 创建一个新的Role,或者使用已有的Role,这个Role必须有访问AWS Glue的权限

2.3 在IAM下查看Role所关联的策略,关联“AWSGlueServiceRole”

2.4 在已有的lambda_function.py中可以直接编写代码,并点击“Deploy”部署

2.5 下边为执行Crawler的代码,要指定crawlername,点击“Test”,可以在“Execution results”中看到相关的日志

2.6 其次,创建一个检查Crawler作业状态的Lambda Functions,创建过程不再赘述,代码如下

3. 创建Jupyter Notebook

3.1 创建Amazon SageMaker 笔记本实例

3.2 创建一个笔记本实例,类型选择t2.medium。选择或者创建一个IAM角色(IAM Role),其他部分选择默认选项,点击创建(Create)

3.3 笔记本创建完成后,打开Jupyter,选择New,新建一个ipynb,选择内核为conda_python3

4. 使用Step Functions Data Science SDK创建和定义工作流

4.1 安装和加载必需的模块

4.2 在Console创建一个Role附加到Step Functions

4.3 定义Step,指定Execute Crawler的Lambda名字

4.4 定义Step,指定Check Crawler Status的Lambda名字


此处采用retry的方式来检查Crawler是否完成,建议先手工执行Crawler评估需要的时间,再定义间隔时间

4.5 定义Step,指定执行Glue Job的名字

5. 运行上述Workflow,指定Workflow Name

5.1 新建名为My-ETL-workflow01的工作流

5.2 生成图示

5.3 执行Work flow,可以看到不同的颜色代表不同的状态,完整执行过程的图示如下

5.4 如果执行失败,可以查看events

6. 总结

本文讨论的是使用Amazon Step Functions Data Science SDK,创建一个基于无服务器架构的数据ETL工作流。对于数据科学团队来讲,这些步骤都可以在Notebook中完成,而且可以通过Step Functions监控每个任务的运行状态和日志记录,最终实现整个流程的自动化,减少数据科学家的人工重复工作,提高生产开发效率。

关于ETL流程的自动化,Glue也自带了Workflows方式来实现,和Step Functions相比较,Glue Workflows是编排内部作业和爬网程序,如果调用Glue之外的其他AWS服务,需要使用Step Functions。

AWS Step Functions AWS Glue Workflows
应用场景

在AWS各种服务之间定义工作流,

处理和移动数据

在多个AWS Glue作业、爬网程序和触发器之间定义工作流
数据治理

管理重试逻辑

正确或错误处理

可做循环

可视化内容

工作流程

每个流程状态

工作流程

每个流程状态

构建方式

AWS Glue Console

API

AWS CLI

 

AWS Step functions Console

API

AWS CLI

AWS SDK

 

Glue Workflow和事件驱动的方式来实现ETL流程的自动化,可参考下边的链接:

如何使用AWS Glue工作流在爬网程序运行完成时自动启动作业?

https://thinkwithwp.com/cn/premiumsupport/knowledge-center/start-glue-job-after-crawler-workflow/?nc1=h_ls

如何使用Lambda函数在爬网程序运行完成时自动启动AWS Glue作业?

https://thinkwithwp.com/cn/premiumsupport/knowledge-center/start-glue-job-crawler-completes-lambda/?nc1=h_ls

 

7. 参考资料

[1] aws-step-functions-data-science-sdk-python

[2] AWS Step Functions Data Science SDK – Compute

 

本篇作者

缪翰林

亚马逊云科技解决方案架构师,负责基于亚马逊云科技的方案咨询,设计和架构评估。在运维,DevOps方面有丰富的经验,目前侧重于大数据领域的研究。