AWS HealthOmics 工作流现在支持调用缓存和中间文件访问

发布于: 2024年11月21日

我们很高兴地宣布，AWS HealthOmics 工作流现在支持重复使用以前的任务结果，为客户节省时间和计算成本。AWS HealthOmics 是一项完全托管式服务，它使医疗保健和生命科学组织能够存储、查询、分析组学数据以生成见解，从而改善健康状况和推动科学发现。此次发布后，客户可以从先前的故障点或代码更改处恢复运行，由此加快新管道的开发。

由于能够调用缓存或恢复运行，客户可以从引入新代码更改的地方重新开始运行，跳过已经计算过的未作更改的任务，从而缩短迭代工作流的开发周期。此外，任务中间文件存储在运行缓存中，让客户可以在开发过程中对工作流错误进行高级调试和故障排除。在生产工作流中，调用缓存可以保存失败运行的部分结果，这样客户就能从故障点重新运行样本，而不是再次计算成功完成的任务，从而缩短了重新处理的时间。

现在，Nextflow、WDL 和 CWL 工作流语言在提供 AWS HealthOmics 的所有区域（美国东部（弗吉尼亚州北部）、美国西部（俄勒冈州）、欧洲地区（法兰克福、爱尔兰、伦敦）、亚太地区（新加坡）和以色列（特拉维夫））都支持调用缓存。要开始使用调用缓存，请参阅 AWS HealthOmics 文档。